万历仍待在宫中“养病”。有人上书批评皇帝“十不如初”：跟太后关系不如以前亲密了；祭祖也让别人代替；不如以前好学，把经筵（大学士进宫给皇帝讲读经书，研讨国事）都罢了。不如以前勤政；祭天也不去了；赈灾不积极，派宦官下去开矿、收税倒挺积极。不如以前节俭；不如以前虚心纳谏；跟诸王关系也疏远了；任贤用能也不如以前。
有人把万历当前的状态总结为“不郊、不庙、不朝、不见、不批、不讲”。简而言之，什么都不愿意干了。
不过也得分什么事。有人上折子说开矿、收税的事。他积极着呢，马上批，马上办。
当时皇宫的坤宁宫突发大火，大火从坤宁宫蔓延到乾清宫。这两座宫殿是皇帝、皇后的寝宫，是后宫的核心宫殿。万历正张罗重修，祸不单行，前三殿又烧了。前三殿是皇帝办公地方，是前宫的核心建筑。
明朝皇宫就是现在的北京故宫。前三宫、后三宫坐落在故宫中轴线上。这些宫殿被烧毁后，大臣上朝，一进午门就能看到御花园。
重修前三宫、后三宫等于重修半个皇宫，工程浩大，花费巨大。
但是国库拿不出这么多钱来修宫殿。宁夏、朝鲜两场战争已经把财政榨干了。
怎么办呢？有人建议皇帝开银矿。找出银矿也就等于找到了聚宝盆摇钱树，取之不尽用之不竭，想怎么花就怎么花。万历很高兴，马上派出大批宦官以矿监的身份去各地找矿开矿。
有人建议加税，这个比开矿来钱还快，并且还没有成本。万历马上照办。宦官作为皇帝的税使，下到地方接管了当地的税务部门，开征矿税、店税、商税、船税。
宦官出去属于皇帝的钦差，没人敢惹。
矿监奉旨开矿，说哪有矿就挖哪，根本不管会给别人造成什么损失。比方矿监来到某处，当地伺候不周或不肯贿赂，惹矿监不高兴了。矿监说谁家下面有矿。手下立即动手拆房。房主不得不贿赂求免。
税使负责收税，任意加税摊派，设卡收费。你拿个针头线脑去卖也得交税。当地的工商业受到严重干扰。受冲击最大的是商业。三步一岗五步一哨地设卡收费让商人的买卖实在做不下去了。有的地方百姓不堪忍受盘剥起来造反。
宦官一边替万历捞钱，一边为自己捞钱。民间怨声载道。不断有人上书万历要求撤回矿监税使。万历不理。弹劾矿监税使的人遭到宦官的打击报复。
后来民变越来越多，万历撤掉了几个民愤极大的矿监税使以平民愤，但仍不肯取消矿监税使。
1597年，朝鲜战争再次爆发。
明朝跟日本的和谈旷日持久，但最终以破裂告终。丰田秀吉要求跟明朝和亲通贡，并且让朝鲜把南部割让给日本。明朝答应册封日本，但不准日本通贡，要求日本立即撤兵并且发誓再不入侵朝鲜。双方谈判条件差距太大，最终导致破裂。
日本增兵12万乘坐上千条战船再次入侵朝鲜。加上釜山留守日军，日军的总兵力达到14万。日军向汉城方向发起进攻。
明朝得到战报立即派兵增援朝鲜。
当时，东北蒙古人进犯沈阳。朝廷留李如松对付蒙古人，派右佥都御史（相当于中央巡视组组长）杨镐率军先行入朝。
李如松率兵长途奔袭蒙古人的老巢，不幸遇伏战死沙场。
杨镐率军4万进入朝鲜，率领明、朝联军向日军发起反攻。两军在蔚山爆发激战。
蔚山日军不多。他们使出缓兵之计，以诈降拖延时间等待援军。杨镐中计了。他没有发动进攻而是坐等日军出来投降。等他发现日军大部队赶到对他形成反包围时大惊失色，弃军而逃。明军无人指挥被日军杀得大败，损失惨重。
杨镐退守汉城收罗残兵败将，统计人数，伤亡两万人。杨镐瞒下不报，向国内谎报军情，把败仗说成胜仗，把损兵两万说成损失百余人。朝廷下令嘉奖。赞画主事（相当于参谋长）丁应泰气不过，上书揭发杨镐的无耻行为。万历大怒，下令杀了杨镐以正军纪。时任首辅赵志皋是有名的老好人，把杨镐救下，仅仅给与免职处分。
明朝增兵再战。而此时日军却开始撤军。
取得蔚山之胜的日军将领是丰臣秀吉的养子。丰臣秀吉不愿他立功过多、声誉过高，怕影响自己亲儿子继位，令他率本部军回国休整。侵朝日军一下少了一半人。
明军增援部队入朝后再攻蔚山。而此时丰臣秀吉又得病死了。侵朝日军一看老大都死了还打什么打，于是全线撤退。
明朝和朝鲜水军联手在海面上追杀日军，令日军损失惨重。
南海是朝鲜战争的第二战场。明朝水军跟朝鲜水军联手跟日军舰队周旋，打了很多胜仗。
韩国有部电影《鸣梁海战》描写的是朝鲜战争中一次著名的海战。朝鲜水军以少胜多打败了日军舰队。
装备了火炮和铁甲的朝鲜战船在朝日海战中出尽了风头。朝鲜的铁甲战船被称为“龟甲船”，浮在水上象一个铁壳乌龟。龟甲船冒着敌人的炮火冲向日本舰队，连轰带撞，把敌船打得粉碎。日本缺铁，舍不得给战舰披铁甲，结果吃了大亏。
但是海军的胜利只能干扰日本的海上运输线，扭转不了整个战局。主要战场还是在陆地上。
因为日军主动撤退，这场战争最终以明朝和朝鲜一方获胜而告终。
丰臣秀吉死后，日本再次陷入内战。德川幕府跟丰臣家族为争夺日本控制权展开大战。丰臣秀吉的那个养子临阵反水，使丰臣家族一败涂地。德川攻陷丰臣的据点大坂。丰臣家的武士全部力战而死。丰臣秀吉的儿子切腹自杀。德川代替丰臣掌握了日本大权。日本从此进入江户幕府时代。