独立出来的海军统帅部下属设立海军军令部、海军参谋部、海军后勤部、海军舰政部等部门
同时把内阁的兵部一分为二，设立陆军部以及海军部，分别负责陆海军的支援工作
除了海军高层机构的变化，李轩还对舰队编制进行了改动，旨在筹建两支舰队，分别是负责整个珠江流域等内河作战的珠江舰队，负责远洋作战的南洋舰队！
当然了，李轩这一系列对海军的体制，改革，实际上也是影响到了陆军方面，海陆军彻底分家之后，李轩也是对枢密院进行了一定的改变，详细的机构不变，但是称呼却是变了，枢密院下属各司，大多升格为部，比如作战司改称作战部、军械司改称军械部。
不过总的来说，陆军方面的改动并不大，最大的改变就是换了个称呼而已，然后顺便给新任各部的部长们升升官，不再是上校了，而是少将军衔起步了。
其实枢密院以及海军统帅部，其机构的设置是非常类似的，只不过一个管陆军，一个管海军而已。
然而，海陆分家后，各种事情也是接着冒了出来，而其中最大的分歧自然是军费的分配了。
以前海军和陆军没分家，这军费都是一起用，但是现在海军分家单独过日子了，自然是要分军费的，而军费就这么多，海军拿多了，陆军自然就少了。
于是乎，海陆军分家之后，大唐王朝所遇到的第一件大事不是又从明军手中夺取什么重要城池，或者是歼灭了明军多少人，更不是什么某些政治大佬倒台之类的，而是海陆军因为军费分配而爆发的矛盾！
这场矛盾一开始只是陆海军共同派员协商关于本年度后续的军费分配问题，而一开始，彼此双方都不认为会爆发什么矛盾的，因为陆海军双方都认为自己的条件是合情合理的。
但是这种合情合理，在对方看来却是狮子大开口，属于绝对无法能够接受的。
陆军方面，在本年度接下来的军费分配中，陆军因为任务繁重，要想同时发起湖广、云南、福建、江西等方向的军事行动，同时随着占领区的扩大，需要留守各占领区的兵力也是越来越多，依靠现有的兵力是远远不够的，所以必须继续大量的扩充陆军数量，如今的陆军规模远远不足，最少需要翻一倍甚至是两倍。
而海军，不过就是给陆军打打下手，帮忙运输一些后勤物资而已，而且随着广州战事的结束，后期大唐陆军的作战方向，海军基本帮不上忙，甚至是连后勤物资的运输都是无法办到了。
基于这样的现实，陆军方面提出，接下来的军费分配，应当遵循宣平二年上半年的军费分配原则，上半年海军拿了多少，下半年继续拿多少。
这都不削减海军军费就算是给面子了，至于想要再多，基本是别指望了
因此，陆军提出来的军费分配比例是多少了，陆军百分之九十五，海军百分之五。
是的，没错，陆军就是这么牛逼，只给海军留下了区区五个百分点的军费分配比例。
而海军方面则是认为，拿下了广东后，大唐王朝的海防压力甚大，是需要大量军费的投入用以建造战舰、修筑炮台用以巩固海疆，同时为后续从沿海发起对福建、浙江、江苏等地的进攻奠定基础，因此是需要大力增加海军的军费的。
海军方面自然是不指望能够和陆军平分军费，毕竟如今大唐王朝的主要用兵方向是湖广，陆军拿多一些也是情理之中。
所以海军方面提出的方案是海军拿百分之三十，陆军拿百分之七十，三七分，足够体现海军的忍让了。
一方面是百分之五，一方面是百分之三十。
这个差距大到没边了，根本没有办法进行协调。
陆海军双方尝试了好几次都是无法友好协商解决，然后就是变成了争吵，一开始是他们自己相互派人在协调会议上进行小规模的争吵，然后陆海军的高层亲自出马争吵，再发展到双方在李轩面前争吵。
在这场争夺军费的战役中，不管是强大的陆军还是弱小的海军，都是丝毫不让，海军那边的包义奋海军少将以及一群海军中高级将领，天天都是为此事奔走，而包义奋每一天都是找借口去见李轩，去了啥也不干，就苦海军多么可怜多么可怜！
海军坚信，会哭的孩子有奶喝！
面对海军如此不要脸的哭诉，陆军将领自然也是拉下了面子，一点都不顾及体面，作战部部长曾子文为首，留守京都的一群陆军高层们天天缠着李轩，一有机会就说陆军多么多么苦逼，众多陆军将士们没有枪炮可用，只能是用血肉之躯和敌人的枪炮作战，每每作战死伤惨重啊！
以至于李轩都无语：陆军将士用血肉之躯对战明军的大量枪炮？
你们这是说反了吧！