经过仔细的讨论，司马珂跟司马衍达成了一致意见，定出了王室六军的拟拜将领。
左卫军，以卞诞为左卫将军，以吴郡陆家之子陆纳为军司马。
右卫军，以褚蒜子的父亲褚裒为右卫将军，以吴郡朱家之子朱能为军司马。
骁骑军，以桓温为骁骑将军，以会稽虞家之子虞啸父为军司马。
领军军，以谢安的从兄谢尚为领军将军，以吴郡张家之子张澄为军司马。谢尚也是历史上赫赫有名的战将，这样也算是给了谢安一个面子，借机拉拢了陈郡谢氏。
护军军，护军将军的位置暂时没有合适人选，暂由甘苗兼领，以吴郡顾氏之子顾会为军司马。护军将军毕竟是右第四品的大员，在没有合适人选之前，司马珂是宁缺毋滥。
游击军，仍以甘苗原班人马不变。甘苗虽然是王导的心腹，但是其出自江东士族，且有内应之功，又与司马珂有并肩作战之谊，完全是可以借机拉拢的，所以司马珂并没将其孤立，反而予以重用。
这样一来，王室六军的统领几乎全部大换血，不但悉数换上了司马珂亲近之将，而且借机把江东士族的子弟纳入中央军阵营，也算是给江东士族注上一剂强心针，坚定江东士族支持自己的信心。
两人商议了大半个时辰之后，终于确定了王室六军的组织架构之后，司马珂和司马衍都松了一口气。
好在司马珂在这半年之间，结识和拉拢了不少亲近自己的力量，不至于落到无人可用的尴尬境界。
这也是为什么士族力量千年不息的原因。不管你势力如何强横，但是一旦摊子大了，无论是内政还是治军，都需要人才，而天下的人才有七成以上聚集在士族之中，你不用士族就无人可用。寒门庶族不是没有出贵子，但是太少了，光靠几个凤毛麟角的人物，支撑不起庞大的国家机器。除非像胡虏一样，只破坏，不治理，像疯狗一样乱咬，否则在这个时代终究是不能脱离士族的支持。
除此之外，其他军马，也做了相应的整顿。
沈劲解虎贲中郎之职，领屯骑营，拜屯骑校尉，封白马子，以渤海刁氏之子刁协为司马。
中护军纪睦，加封为都乡侯，食邑五百户。
羽林骑都尉周琦，晋升为羽林监，官阶右第五品，仍领羽林骑，加丘县子。
原天策军长史荀蕤，晋升为天策军督护，天策军主簿李颜迁为天策军长史。
至于镇军将军周谟所率的城郊守军，暂时维持原样不变。对于司马珂来说，要想整顿好京师之内的王室六军、五营校尉和天策军，已是一向任重而道远的事情，暂时没有精力去管城外守军。周谟虽然与王导亲近，但并非是王导的铁杆心腹，而且周谟此人也一向忠直果敢，也算是颇有才干的将领，只要徐徐拉拢之，迟早成为自己的心腹之将。
更重要的是，司马珂的根基太浅，暂时没有足够的治军班底来接手周谟那一万大军的摊子。
两人针对各军的将领任免之事计议已定，最后便是讨论关于赵胤和贾宁的处置问题。
赵胤出自江东武将世家，其父亲赵诱和其兄赵龚皆在平定杜曾叛乱之中战死，也算是忠烈之后，按照司马衍的意思，只诛杀赵胤一人，抄没家产，将其家族贬为庶族即可，没必要株连三族。
贾宁的处置也一样，贾宁原本就是流民帅出身，算不得士族，直接处决，并将其家产抄没即可。
但是关于两人的处决方式，司马珂坚持要以“弃市”而斩。“弃市”就是在人众集聚的闹市，对犯人执行死刑。这对士族来说，在成千上万的寒门和黔首的面前像杀鸡杀狗一样的斩杀，是极其丢脸的处决方式，也只有这样才能震慑其他有异心的士族。
最后，司马衍意味深长的看了司马珂一眼，道：“赵胤、匡术、贾宁及路永四人，家资不菲，便由皇叔全权负责查抄，不必入国库，全部充作中央军之军资，此乃朕之旨意，皇叔不必多心……”
所谓手中有粮，心中不慌。有了钱粮，才能给士兵奖赏和福利，才能打造精锐的装备，才能稳住军心。司马珂自然不能拒绝。
投桃报李，这可算是小皇帝极大的恩宠！