话说远在南海之南，有一片神秘海域，因海底遍布红毛藻，导致整片海域赤红如血，故称之为赤海。
赤海有岛屿数万，最大的海岛被称为太湖岛。严冷锋、陈忘乘风破浪，披荆斩棘，历经千难万险，终于抵达太湖岛，然此岛却并非赤龙巢穴，二人于岛上搜寻得中原古籍，更引出一段“双龙渡劫”的悲剧故事。
古籍记载，北宋末年，梁山好汉聚义造反，屡败高俅，声势日渐壮大。同时明教方腊于南方起兵，侵吞长江以南大片宋土，引起朝野震动！
徽宗赵佶闻蔡京报，急启用于北方宋辽战场屡立奇功的三位江湖豪杰：周侗、燕林天、南定方出兵平叛，第一个目标便是梁山泊。
这一战打了足足数月有余，双方势均力敌，相持不下。然鬼谷纵横家的谋略总是高人一筹，竟出奇招策反了梁山二当家卢俊义、六当家林冲、十四当家武松以及当地曾头市教头史文恭，致使梁山泊元气大伤，一战而败！
梁山泊被平叛之后，周、燕、南联名上书朝廷，愿以战功换取梁山一百零八头领之性命，赵佶欣然应允。之后周侗自与燕、南隐退，而梁山泊一众人则在赵佶的命令下南下征讨明教。
从梁山泊起义，到归附朝廷的整个过程中，有对周、燕、南心怀感恩的，比如卢、史等人，也有对他们心存不满的，比如花荣、董平、张清、李逵、燕青等，甚至多的是心怀怨恨的，他们不明白为什么同为江湖好汉，定要互相倾轧？为什么不一起起兵造反，博取万世之基业？要知道朝廷昏庸，奸臣当道，正是英雄崛起之时，就算你们没有谋反之心，也不必挡我梁山之道啊！
只可惜被招安的事实已经造成，虽然心存芥蒂，但周、燕、南三人的救命之恩不得不报，于是在宋江的带领下，梁山好汉一路南下，踏上了征讨武林同道的征途。
关于梁山明教之战，不管是科技世界《水浒传》中的书写，还是修炼世界口口相传的故事，都是一段可歌可泣的悲情传说。在《水浒传》中，梁山好汉虽然讨平方腊，但亦死伤殆尽，仅存三十二人，结局亦是凄凉；在修炼世界中，方腊得南方武林支持，与梁山大小数百余战，艰难获胜，而梁山重要将领几乎全数牺牲，仅卢俊义、史文恭、鲁智深、燕青、李俊等人幸免于难。
卢俊义、史文恭的存活得益于二人强悍的武道实力；鲁智深则是得林冲、武松拼死救护，之后在六合寺感神圆寂；燕青本就机巧聪慧，战时假死，战后隐遁不知所踪；李俊是得太湖四杰暗中救助，潜入太湖逃过了一劫。
梁山好汉的故事到此告一段落。单说李俊，当时能逃出生天，除了有太湖四杰暗中相助，冥冥之中还有龙族相帮，因为他还有三十二年金龙皇帝命，肩负天庭重任，万不能死在乱军之中。
当时与李俊一同逃走的还有童威童猛，合大湖四杰费保、倪云、卜青、狄成共七人，一同乘船南下，驶向了茫茫南海。
七人在海上历经艰难险阻，自不必说。某一夜，行船漂泊至一片未知海域，李俊看到一小岛，正待命停船上岛，忽见夜空阴云密布，急风骤起，海上巨浪滔天，狂潮肆虐，却是海底生出一条数十丈长的巨型红鲤，凭空跃起，欲渡雷劫！
此等现象被民间传说为“鲤鱼跃龙门”，事实也确是如此。红鲤为龙族近亲，千万年才修成一条，今日却正被金龙撞见，实属世间奇景！
却说那红鲤直冲天空而去，层层密云中劈下树干一般粗的蓝色闪电，只这一劫便将它劈的全身冒烟，鱼鳞脱落，砸入海中，奄奄一息！
自古妖族化身成龙，难如登天！红鲤以千年道行便妄想跨越龙门，跻身龙族，实在有些不自量力。
眼看着第二道雷劫就要降下，红鲤顷刻间便要灰飞烟灭，李俊也不知哪里生出的勇气，竟使出“混江龙”的绝顶水性，飞速潜游至红鲤身旁，宛如一道利箭破水而出，以肉身强行挡下第二道红色闪电！
船上童威六人只见雷劫闪电尽处，李俊的肉身隐约有破裂之相，但仅瞬息之间，其身后竟显出一条金色的五爪龙魂！那龙魂仰天长啸一声，震慑得阴云退散，急风消逝，巨浪瞬落，狂潮湮灭！
雷劫就这样悄然没入浩瀚夜空之中，然紧随而起的是躲过雷劫成功化龙的红鲤！只见它鱼跃长空，激起浪花无数，继而龙身渐长，先有赤爪，后变龙首，龙须显现，而后龙鳞覆身，双目金瞳迸射两道锐利金光，冲天而起，撼动九霄！
红鲤已蜕变为赤龙，之前的鱼鳞片片脱落至海底，为海底生物所吞食，数百年扩散至整片海域，引得红藻生长，成为赤海。
而那夜之后，李俊被赤龙救起，赤龙自身亦化为人形，八人就于岛上建屋搭梁，造出龙穴居、双龙庭、忠义坊，全是中原风格，生活了一年有余。
一年后，李俊龙魂伤愈，精神渐长，思及自身龙魂奇异之处，不禁心生吞天之志，原来自己竟有金龙之命，为何独困小岛不得施展拳脚？他再问及赤龙离海岛最近之国土是何处，得知东北有人族居住，称为百越，目下正值战乱之际，兵祸横行，不宜趟这滩浑水。
赤龙是好心相劝，但李俊却欲大展身手，与童威、童猛商量数日，最终决定一同前往百越干一番惊天动地的大事业。赤龙虽不舍李俊离开，但当时的她极为单纯，只知道一味的付出，不仅在李俊临行前夜奉献了处子之身，还将自身的金瞳龙眼借于李俊，相约功成之后，再回双龙岛双宿双飞。
在这期间，费保曾劝李俊，不可辜负赤龙心意，以免引火烧身；亦劝童威、童猛，功名利禄转眼成空，不如同隐居海岛，闲云野鹤，潇洒此生。但李俊三人全然没听进心里，此后结局果然十分凄惨。
一月后，费保四人为赤龙另寻得一海岛居住，不在话下。而李俊去往百越，在暹罗国以百人众揭竿而起，凭借自身魅力拉拢了无数草莽好汉，以金瞳龙眼之威横扫八荒，统一全境！
这时的赤龙已怀有身孕八载，闻得李俊功成，化身为人，在倪云、狄成的带领下去往梁山城寻李俊归岛，然李俊却性情大变，竟命人围剿赤龙，以保住借来的龙眼。赤龙一怒之下，掀翻了百越朝廷第一秘宝流火灯，几乎焚尽梁山城！之后李俊在梁山城废墟上建立新城，是为百越国都——流火城。
流火一役，赤龙逃脱，倪云、狄成被捕，后在狱中郁郁而终；二十年后，童威、童猛被诬陷谋反，锒铛入狱，后被李俊赐死；又十二年后，李俊驾崩，当日阴云笼罩，天降暴雨，赤龙生掘其墓，令尸体泡浮于雨水中三天三夜，几成肉糊。赤龙也终于收回金瞳龙眼，重见光明，而后盘旋于皇宫长啸三声，凄然离去。
百越一代雄主被掘尸曝露，此等丑事绝不可外泄。于是百越第二任皇帝，李俊之子李微，强令史官修改史籍，并屠杀大批知情官员，以至于五百年后的今天都没人知晓这一段双龙往事，包括百越皇室。
再之后，赤龙回到双龙岛，诞下双龙蛋，悲愤中的她本欲毁坏龙蛋，却被费保劝住，称“龙子无辜，何需如此？”但赤龙并不想看到龙子诞生，费保无法，只得寻千年寒冰将龙蛋冰封于赤龙岛。