如果是其他人问，又或者是其他时候，陈新甲不会说实话，以免被人听到，传到那些有心人耳中，惹来不必要的麻烦，但现在他位置摇摇欲坠，随时都可能会被下旨论罪，又是面对国本，未来的皇帝，所以他也就顾不得那么多了，微微一思索，拱手道：“殿下，恕臣直言，我大明开朝三百年来，鼎定九边，海晏波平，卫所制曾经功不可没，但实至今日，卫所制却已经是弊端多多，不合时宜了，全国在册的卫所兵有百万余，但真正存在的连五十万都不到，能战的就更是少了，不论面对关外的建虏还是中原的流贼，卫所兵都一塌糊涂，毫无战力，但偏偏朝廷每年在卫所兵上耗费银两众多，投入和产出完全不成比例，因此臣以为，要想外抗建虏，内平流贼，卫所制必须有所改变。”
陈新甲所说，并没有什么新意，但却是一种态度的展现。
而朱慈烺要的就是这种态度。
“陈部堂以为该怎么改？”朱慈烺不动声色的问。
“去冗员，选精锐，信号令，责屯种！”陈新甲道。
朱慈烺微微点头，陈新甲所说还是很有章法的，这个兵部尚书也不是白做，还是有点才能的，于是再问：“如果朝廷决意整顿卫所，陈部堂，你能担此重任吗？”
陈新甲吃了一惊，太子此言可是有僭越的嫌疑了，陛下没有令，内阁没有拟，军制改革这么大的事情，太子怎么可能可以妄言？犹豫了一下，随即在马上拱手，朗声回答：“只要陛下有令，臣赴汤蹈火，再所不辞！”
陈新甲回答的四平八稳，朱慈烺却是暗暗叹口气，他当然知道自己刚才的问题有点僭越，正是因为僭越他才要向兵部尚书发问，兵部和其他五部不同，其他五部都可以是循规守旧之辈，兵部却不可以，现今内外兵事不乱，大明节节败退，非有睿智通达，能大破大立之人担任兵部尚书不可，如此方有可能挽回颓势，但看陈新甲将“陛下”顶在前面，显然是没有革故鼎新的决心，非“改革”之才。
也是，历史的改革者都没有好下场，从商鞅到张居正无不如此，陈新甲并不是什么大才，有所忌惮业是正常。而且军制改革关乎大明国运，改好了，大明中兴，改不好，大明就玩完，如此艰巨的任务，确也不是平庸的陈新甲所能承担的。
“对于流贼，部堂又怎么看呀？”
对陈新甲有了清晰的判断，朱慈烺换了一个话题。
陈新甲不明白太子的话题变化为何如此剧烈？不过他也乐意改变话题，于是朗声回答：“殿下，流贼都是乌合之众，虽然势大，但却难以成势，我大明的心腹之患仍是辽东。”
朱慈烺笑一笑，陈新甲虽然有点干才，但终究是缺乏战略眼光，如果没有李自成的帮忙，再过一百年，建虏也不可能攻破北京，在汉家江山上建立满清王朝。所以，大明的心腹之患并不是满清，而是李自成。但李自成并不是天生就是流寇，如果丰衣足食，国泰民安，鬼才愿意造反，所以归根到底，大明朝的问题还是两个字：民治。
至于建虏，只要紧守山海关，重兵屯于蓟辽，加强沿途长城要塞的防守，堵死建虏绕道蒙古侵袭大明的路径，再配合平辽三策，坚壁清野，不出五年，建虏必乱。
看来，陈新甲终究不是兵部尚书的最佳人选。
见朱慈烺忽然不说话了，陈新甲微微忐忑，难道是自己说错话了？
想要问，但又不敢问。
“陈部堂对辽东又怎么看？”
朱慈烺问。
陈新甲精神一振，辽东才是他的强项，也是崇祯任用他为兵部尚书的原因。。
陈新甲滔滔不绝的讲。
朱慈烺静静听。
没有什么新奇的，无非就是扼守关隘，烽火示警，辽人守辽，空话大话一堆，没有提出一个有用实际的策略。
最后，陈新甲终于说到一个还算有用的策略。
那就是彻底关闭马市，不使一粒粮食，一斤生铁流入建虏。
这也是朱慈烺向父皇提出的建议之一。
不过朝堂之上却有朝臣提出异议，蒙古人虽然向建虏臣服，但因为有马市的存在，所以他们并没有全力帮助建虏，一旦断绝马市，就等于是彻底将他们推到了对立面，为了得到粮食和布匹，他们必然也要兴兵寇边，到时，建虏在山海关蓟辽，蒙古人在宣大，两路夹击，以朝廷现在的兵力，必然是左支右绌，无法应对。
再有，一旦关闭马市，朝廷的战马从何而来？没有战马，朝廷又何以剿灭流寇，收复辽东呢？
所以，彻底关闭马市之策在朝堂上讨论了好几次，始终没有定论，最后采取折中之策，决定缩小马市规模。
明末最大的问题就是官员短视，相互扯皮，蒙古人既然向建虏臣服，就已经是大明的敌人了，又怎么能奢望他们看在马市的份上，跟建虏三心二意，不全力帮助建虏呢？