在这个过程之中，奥布和ZAFT甚至还联合做戏出军压过联合的界限，迫使联合必须派兵进行应对，而趁着这个时间，则派出了精锐部队前往联合势力范围内进行剿灭作战，也终于将普雷亚所提供情报中的所有图书馆馆员基地全部覆灭。
基地，器械，克隆设备，在萧然的坚决命令下，所有的东西只要在作战之后就会由白银之手的成员监督着全部毁灭，但哪怕是这样，直到图书馆馆员这个组织已经从里到外全部瓦解毁灭，但那个吊在萧然心中的支线任务也一样还是没有完成，似乎是在逼迫他作出一个无可奈何的抉择一样。
在知道了最后一个影印人基地已经瓦解之后，萧然在还没有听到任务完成的情况下独自坐在办公室之中死死的皱起了眉头，手中极有规律的按着顺序和节奏轻轻的在桌面上敲打着：“难道就没有办法了么，只能选择放弃或是杀掉我的影印人了，不，应该还是有其他办法的。”
想得烦躁的萧然站了起来，来回的在自己的办公室里走动着，忽然像是想到了什么一样连忙将自己的秘书官叫了进来，让秘书官去将被制造出来但却使用的是其他参与者这种明显非人类基因的影印人给处理掉，相比起萧然的影印人来说，这些有着外星人基因的影印人才是真正对这个世界人类来说影响最大的，弄不好就会在这个世界搞出一个新的种族。
而对于他答应的准备留下一名的三个影印人，毕竟是以他萧然这个人类为本体制造出来的，威胁性远远比不上被制造出来的几个试验品，当然萧然也不可能就放任着三人目前的情况不管不顾，所以萧然唯一能够想到的就是破坏他们三人的基因结构，让他们的基因崩溃或者多出一些原本没有的东西，而想要做到这一点就有着一个非常现成的办法，联合的强化人技术。
强化人本质上还是人类，但实际上在基因层面已经和正常人完全不同了，以正常人的种族获得调整者的身体素质和能力，这本来就属于一种对人类的改造技术，这种技术会破坏个体的基因，使用药物或者其他方面的改造来剔除一些没有用的东西并加入一些有用的东西，被强化人技术改造过的人，也可以说拥有了和曾经完全不同的身体。
但一旦开始强化人改造，那么被改造的人就会拥有和史黛拉他们以前一样对药物的依赖性，恰恰在这种依赖性上萧然才是最不担心的，使用治疗舱就可以让他们的基因得到固化，而且哪怕在被其他人得到基因，但那种基因也和萧然的完全不同了，从某种角度来说也算是消灭了相关克隆者，准确的说是相关克隆者所给这个世界带来的威胁。
想到了这个办法的萧然，立刻就让人找到了由巴基露露递交回来的强化人技术资料，开始将所有属于自己的影印人，某些虽然使用人类基因为蓝本，但却同样加入了参与者基因的影印人聚拢在了一起，强迫性的在以不伤害他们性命的前提之下开始对他们进行了惨无人道的强化手段，但想要得到最终的结果却不是一两个月就可以完成，而萧然也不可能其他什么都不管就这么每天盯在这件事情上，他还有更为重要的事情需要处理。
萧然当初给联合的最后期限的时间已经过去，该脱离联合的都脱离了联合，退出了世界安全保障联盟，而没有退下的，也在PNT和奥布，准确的说是在迪兰达尔和萧然的双重影响下，被世界所有的势力，平民默认成为了LOGOS的爪牙，从而开始了对地球上联合势力的最后清剿。
最预定好的作战计划当中，PNT奥布将共同派出绝大部分兵力，直捣黄龙进攻目前联合最为重要的一个基地，同时也是目前LOGOS在地球这个大环境之下的大本营，根据可靠消息，在之前的混乱之中没有抓住的LOGOS成员此时已经全部聚集在了那里，而且同样也是联合目前除了月球基地之外最为重要的一个基地，一旦成功击溃那里的敌人，那么对付LOGOS的事情就可以告一段落，而且地球也算是完全落入了奥布和ZAFT的掌握当中。
当然，奥布在一点上的确是坚持了自己的理念，根本就没有想要去占领出了奥布领土之外其他地域的想法，所以就算那边的地方攻下来干掉了大西洋联邦和欧亚联邦，在那边当家作主的也不会是奥布，而是PNT。
就在萧然给出最后时限过去了一周之后，奥布，联合，东亚联邦以及各势力组成的舰队便出现在了联合那个基地的前方，这个机体同样是一个建立在海边的大型军事基地，有着恐怖的防御，就像是一个刺猬一样不管谁去攻击不受伤都是一件不可能的事情。
而此时在那么多力量的联合之下，特别是奥布同样加入了这场针对于LOGOS的战争之下，奥布所组成的白银之手王牌机师部队却极大的增强了这支联合部队的力量，萧然更是放下奥布那边的一切工作亲自驾驶着正义高达出现在了战场之上，但和之前不同的是，基拉并没有参加到这次的战争之中，所以子夜高达也还是换回了原来大气层内使用的背包由玛尤驾驶着加入到了战斗。
战斗虽然显得很顺利，特别是在萧然带着白银之手的加入之后更是如此，不过虽然顺利可参与到战斗的部队损失却并不小，ZAFT出兵最多，自然损失也就最大，不计较伤亡人数，只说战舰和MS的损失就超过了一个标准舰队的规模，哪怕是奥布在这场战斗之中，也同样牺牲了不少的人，同样也损失极大。
特别是联合基地之中出现了八台毁灭高达，给攻击一方的部队带来了极大的损失，最后却被萧然拆掉了三台，阿斯兰和真各自拆掉了两台，剩下一台则在乱战之中被群殴击破。