风云骤变，众大臣目瞪口呆。刘健等顾命大臣愤而请求退休。明武宗立即照准。
刘瑾因祸得福，名正言顺地掌握了朝廷大权。他对大臣们进行疯狂的反扑，把请愿大臣定为奸党，撤职、下狱甚至处死。
在“奸党”里面有一个人值得一提，他叫王守仁，是古代唯心主义哲学的代表人物。他是“心学”的创始人，跟理学的创始人朱熹齐名。
王守仁在明武宗一朝是兵部主事（相当于国防部处级干部，六品官），因为得罪刘瑾，被刘瑾杖责四十，贬到贵州龙场（贵州贵阳郊外）做驿丞（驿站的主管，无品级）。贵州那时还是未开化地区，内地很少有人去。
王守仁在龙场也没有事做，开始思考哲学问题，史称龙场悟道。七年悟道终成心学，王守仁招徒授业，成为心学创始人。
后来刘瑾死了，王守仁又被召回朝廷任职。王守仁文武双全，上马治兵，下马治民，封官加爵直至兵部尚书、伯爵。工作之余，王守仁不忘完善心学，传授心学。嘉靖年间，王守仁因病死在任上。他的心学由他的学生们传承下去。
刘瑾在清洗朝堂之后，顺势把自己人安插进去。从此内阁完全被刘瑾控制。朝堂之上慢慢都成了刘瑾的人。
刘瑾下令所有请示汇报必须由他过目转呈皇上。这样一来，外界传到宫中的消息必须经过刘瑾“过滤”过才能被皇上知道。
内阁都是刘瑾的人，唯刘瑾的马首是瞻。按照规矩，内阁票拟经皇上批准后交司礼监批红盖印。但刘瑾当权之后，内阁不敢私自票拟，都是打听清楚刘瑾的想法之后才敢票拟呈上。刘瑾等于集票拟、批红盖印权于一身。朝廷成了他的一言堂。刘瑾一手遮天。
武宗爱玩，刘瑾就顷国库所有供其玩乐。国库空了就设法搜刮百姓，卖官鬻爵。
刘瑾总挑武宗玩得最开心时候去汇报工作。武宗不耐烦了，道：什么事都来烦我，我还要你们干嘛？
刘瑾等的就是这句话。从此把这些“苦活儿、累活儿”都揽了去，让皇上专心游玩。众大臣的奏章都由刘瑾代皇上批示。刘瑾俨然成了二皇帝。大臣们背地里称刘瑾为“立皇帝”，称明武宗为“坐皇帝”。因为上朝时明武宗坐着，刘瑾站在皇帝身后。
刘瑾把持朝政，专横跋扈，胡作非为，惹起众怒。但是朝臣敢怒不敢言。
有个太监写了一封匿名信，揭发刘瑾打压忠良，提拔奸佞。他把信扔到金銮殿上。朝臣上朝时拾起交给了皇上。武宗大怒，提笔在信上批到：你说贤的我偏不用，你说奸的我偏要用！把匿名信交给刘瑾彻查。
刘瑾扣留了文武百官，让他们跪在大殿前直到供出写匿名信的人。大臣们跪了一天。有的坚持不住晕了过去。到了晚上还没人出来自首。刘瑾下令将大臣们全部收押，准备上刑审讯。
第二天，顾命大臣李东阳上书求情。刘瑾看在李东阳的面子上释放了大臣们。
李东阳跟刘健一样也是明孝宗任命的顾命大臣。但是他年老多病，从不来上朝，也很少过问政事，只是一个挂名的顾命大臣。因为李东阳做过明武宗的老师（太子太傅），明武宗对他高看一眼。刘瑾也不能不给李东阳三分薄面。
同样是武宗亲密玩伴的太监张永不满刘瑾独揽大权，经常跟刘瑾闹别扭。有一次当着武宗的面跟刘瑾打了起来。武宗很不高兴。
恰逢安化王（封地在甘肃庆阳县）谋反。武宗派张永做监军去平叛，趁机把他外放出宫。
张永领兵出京，还没到安化。叛军已被周边官军所灭。张永到了安化只是善后而已。
张永在安化了解到地方对刘瑾怨恨极深。安化王也是打着讨伐刘瑾清君侧的旗号造反的。
平叛部队的主帅杨一清曾被刘瑾诬陷下狱，得李东阳搭救得免，对刘瑾恨之入骨。他知道张永跟刘瑾有矛盾，暗地里劝张永揭发刘瑾的罪恶，除掉刘瑾。张永也愿意取刘瑾而代之，决定跟杨一清联手除掉刘瑾这个祸根。
张永押着安化王回京报捷。武宗很高兴，请张永进宫喝酒。张永趁机揭发刘瑾的罪行。他跟武宗讲：安化王其实并不想造反，这都是被刘瑾逼的。他把刘瑾的种种胡作非为告诉了武宗。他说，刘瑾不除，国无宁日。还会有人被刘瑾逼反。并且刘瑾本人就有图谋造反之心。
武宗已经喝得半醉，说刘瑾造反干嘛？张永说：“取天下”。武宗并不在意，说：“天下任彼取之”。天下他愿意拿走就拿走。张永说：天下如果归了刘瑾，您去哪啊？武宗马上酒醒了。什么东西都能送给刘瑾，就是天下不能。天下如果归了刘瑾，我不就成奴才了吗？
不过武宗对刘瑾谋反半信半疑。他下令调查此事，让人先把刘瑾抓起来，然后搜查刘瑾的官邸。他要亲眼看到刘瑾谋反的证据后再定刘瑾的罪。
没想到还真搜出了不少违禁品，例如铠甲、印玺、玉带、与收入不相符的大批财物等。甚至还发现刘瑾经常拿着的扇子中暗藏了两把匕首。这是想刺王杀驾啊。
武宗非常震惊，下令剐了刘瑾。刘瑾一党也随即被清除。
张永因揭发刘瑾谋反有功，得到武宗的奖赏。但他并没能取代刘瑾的地位。武宗仍让张永负责军事方面的事情。武宗也留了个心眼，不想再培养出第二个刘瑾。
不过张永把杨一清引进了内阁。而杨一清入朝后开始拨乱反正，废除了刘瑾时期的弊政，重新启用或召回了被刘瑾迫害的人。败坏的朝政开始得以修复。
刘健、王守仁等就是在此时陆续回朝。