窝阔台的皇后乃马真跟耶律楚材等人商量怎么办。
耶律楚材说既然大汗有意让皇孙继位，那就按照大汗的意思办吧。也就是说，宣布窝阔台生前指定失烈门为继承人，然后召开忽里台大会。
虽然说大汗指定不能代替忽里台大会推举，但被大汗指定为继承人的人在忽里台大会推举过程中占有非常有利地位。
但乃马真皇后不喜欢阔出，不想把汗位传给失烈门。她想把汗位给大儿子贵由。
皇后说皇孙年纪太小，我想让贵由继位，但是贵由西征还没回来。
有人说您可以暂时摄政，等贵由回来再说。
于是，皇后宣布临时摄政，择期召开忽里台大会。
皇后以种种理由推迟召开忽里台大会，直到她通过拉拢贿赂确定自己的儿子能够当选。这一拖就是五年。
贵由如愿以偿做上了大汗。但他威望不够，人心不附。首先拔都就不服他。
拔都是成吉思汗长子术赤的儿子，在术赤死后继承了术赤的汗位和封地。在成吉思汗孙子辈中，拔都战功最大。第二次西征，窝阔台让拔都担任总指挥，让贵由随军出征。在军中，贵由不过是拔都的部下。
拔都不服贵由，不承认贵由的大汗地位。贵由的即位大典，拔都拒绝参加。
贵由于是率兵讨伐拔都。
1248年，贵由率军从蒙古首都和林（在蒙古首都乌兰巴托西南）出发西征。当他走到新疆的时候，突然暴病而死。人们都怀疑是拔都派人下的毒。
贵由又死了，蒙古帝国再次陷入夺位大战。
贵由也是暴死，生前也没有指定继承人。皇后海迷失野心很大，想过把摄政瘾，宣布遵照窝阔台遗愿，立失烈门为大汗继承人。“后（指海迷失）抱子失烈门垂帘听政”。
她之所以这么做是因为贵由的儿子都已成年，并且不是她所生。失烈门当时年纪尚幼，并且曾被窝阔台内定为大汗继承人。她让失烈门继位容易得到支持，也容易掌握权力。
但是她毫无政治经验，没有能力处理国家大事。并且她上台以后蒙古遭遇了百年一遇的天灾，牧草枯死，牛马饿死。人们迁怒于她，把她看做扫帚星。
拖雷的遗孀唆忽塔尼趁机串联诸王，打算推翻海迷失。
拖雷当年跟窝阔台争夺汗位失败，不久暴死。大家都怀疑是窝阔台毒死了拖雷。唆忽塔尼想让儿子蒙哥继承拖雷的遗志，夺回大汗之位。
唆忽塔尼公关能力很强，争取到了拔都的支持。拔都出面组织忽里台大会，推举蒙哥为大汗。
拔都自己没有参加竞选。他知道自己背负弑君嫌疑，竞选大汗的希望不大。所以他力挺堂兄弟蒙哥为大汗。
海迷失一派拒绝承认拔都主持的忽里台大会的合法性，但是无济于事。海迷失一直拖延召开忽里台大会已经惹恼了蒙古贵族。大家不在意谁做大汗，只想赶紧结束海迷失的统治。
海迷失气急败坏，谋划弄死蒙哥。但她的阴谋被蒙哥发现。蒙哥让人把她装进布袋沉河淹死。
因窝阔台病死而引发的汗位之争长达十年之久。因为汗位之争，蒙古出现离心倾向。各大汗国只在名义上臣服大汗，实际上已经开始自行其是。
汗位争夺期间，蒙古的扩张战争基本停滞。
宋蒙边境冲突不断，但都是局部战争。南宋抗住了蒙军的进攻后趁势反攻，将蒙军之前占领的的南宋领土陆续收复。
蒙哥上台后重启扩张战争，命三弟旭烈兀率军西征阿拉伯，命二弟忽必烈率军南下侵宋。
旭烈兀西征非常顺利，攻陷巴格达，杀死哈里发（政教合一的国家首脑），灭掉了有500年历史的阿拔斯王朝，并在那里建立了一个新的汗国——伊利汗国。加上之前中亚察合台汗国、新疆的窝阔台汗国和东欧的钦察汗国，蒙古一共有四大汗国。
1252年，忽必烈带兵大举南下。蒙宋战争再次进入高潮。